20 mars 1963. Alors qu'ils sont sur le point d'être transférés, 302 prisonniers et gardiens d'Alcatraz, la plus célèbre prison des Etats-Unis, disparaissent dans des circonstances mystérieuses. Trente ans plus tard, lors d'une enquête de routine, la détective Rebecca Madsen découvre une empreinte d'un des 256 prisonniers disparus d'Alcatraz. Comment est-ce possible ? La jeune femme va alors s'engager dans une enquête bien plus compliquée que prévu...